Смотря какой контекст. Можно поставить как are, так и were
ответ: Are you in the office?
Объяснение: Перевод - ты в офисе? Мы используем время Present Simple, и задаём общий вопрос, в котором глагол to be переходит вперёд. А к местоимению you глагол to be меняется на are.
