У кишечнику процеси травлення починаються в тонкій кишці. За участю ферментів підшлункової залози в ній проходить гідроліз складних полімерів (білків, вуглеводів, жирів, нуклеїнових кислот) до дисахаридів і поліпептидів. Подальше розщеплення до моносахаридів, жирних кислот, амінокислот, моноглицеридов відбувається на стінках тонкої кишки (на мембранах кишкового епітелію) за до кишкових ферментів. Скорочення кишечника сприяють перемішуванню, розтирання вмісту, забезпечуючи його просування.
У товстій кишці всмоктується вода, формується щільне вміст, потім відбувається його евакуація з організму. Однією з найбільш важливих вважається ендокринна функція кишечника. Його клітини синтезують пептидні гормони (панкреозимин, секретин, кишковий глюкагон, вазоактивний інтестинального пептид, гастроінгібірующій поліпептид, нейротензін, мотілін і ін.), Які забезпечують регуляцію травної та інших систем. Найбільша кількість подібних клітин знаходиться в дванадцятипалій кишці.
