Промежуточный мозг отвечает за все виды чувствительности, координирует мимику, жестикуляцию, другие проявления эмоций. Контролирует практически все сложные рефлексы движений (бег, ходьба, плаванье). Регулирует обмен веществ и энергии в организме, управляет деятельностью вегетативной нервной системы. Контролирует пищеварительную, дыхательную, сердечно-сосудистую системы, а также эндокринную (находится гипоталамус, выделяющий нейрогормоны для контроля всей эндокринной системы, к примеру адренокортикотропные гормоны). Участвует в терморегуляции.
Средний мозг содержит ядра, регулирующие мышечный тонус и контролирующие рефлекторные дуги ориентировочных рефлексов на зрительные и звуковые раздражения.
Продолговатый мозг осуществляет связь спинного мозга и головного мозга (выполняет проводниковую и рефлекторную функции). Здесь находятся первичные центры сердечно-сосудистой, пищеварительной и дыхательной системы, а также центры защитных рефлексов (чихание, кашель, моргание).
