Як деструкція, так і денатурація — це процеси зміни білком своєї нативної структури. Але деструкція — це процес повної втрати білком своєї структури, який являється повністю незворотнім, в той час як денатурація — це процес зміни білком нативної вторинної, третинної та четвертинної структури, який може навіть при певних умовах відбутися в зворотному напрямку . Деструкція частіше усього виникає під впливом термічних факторів, тоді як денатурація — під впливом різноманітних хімічних факторів.
