Хитридиомикоты - отличаются крайне плохо развитым мицелием и талломом, представленным в основном плазменным телом и гифами. Наиболее примитивные представители - одноклеточные. Отдельные представители не имеют клеточной стенки. Некоторые - лишены мицелия.
Зигомикота - имеют развитый мицелий с изменяющейся толщиной, септы в котором образуются только под репродуктивные органы. Их таллом представлен клетками, которые содержат в себе большое количество ядер. Многие - классические почвенные грибы. Отдельные представители к образованию микоризы.
Аскомикута - их мицелий имеет септированную структуру. Характерно наличие специфических органов спороношения - аск (сумок), в каждой из которых обычно находится до 8 аскоспор. Многие из них относятся к дрожжевым грибам. Некоторые - вторично одноклеточные организмы, утратившие образовывать мицелий.
Базидиомикота - споры данных грибов производятся в базидиях, булавовидных органах для которых характерно образование спор на стеригмах (узкие выросты на их концах). Имеют септированный мицелий, клетки имеют по два гаплоидных ядра.
Оомикота - характерно ценоцитное (мнгоядерное) строение клеток мицелия. Он не имеет никаких перегородок, кроме тех, что отделяют половые органы. Очень слабо ветвится. Отдельные представители образуют плазмодий.
