Центральная нервная система состоит: спинного мозга, головного мозга. Спинной мозг – лежит в позвоночном канале, занимая примерно 2/3 его объема. У крупного рогатого скота и лошади его длина равна 1,8–2,3 м, масса 250–300 г, у свиньи – 45–70 г. Он имеет вид цилиндрического тяжа, несколько сплюснутого дорсовентрально. Четкой границы между головным и спинным мозгом нет. Головной мозг – помещается в черепномозговой коробке и состоит из нескольких частей. У копытных относительная масса головного мозга 0,08-0,3% от массы тела, что составляет у лошади 370-600 г, у крупного рогатого скота – 220-450, у овцы и свиньи – 96-150 г. У мелких животных относительная масса головного мозга обычно больше, чем у крупных. Головной мозг копытных полуовальной формы. Головной мозг имеет несколько отделов обонятельная луковица, продольная щель, полушария большого мозга, полушария мозжечка, спинной мозг, надсильвиева борозда, эктомаргинальная борозда, маргинальная борозда, эндомаргинальная борозда, поперечная борозда мозга, червячок мозжечка.
