Метаболизм микробной клетки определяется суммой всех реакций распада поступающих веществ (катаболизм) и синтеза структурных компонентов клетки и метаболитов (анаболизм) катализируемых ферментами клетки. Метаболизм микроорганизмов имеет ряд особенностей:
Микроорганизмы используют большое количество разнообразных источников углерода и энергии; Метаболизм микроорганизмов характеризуется высокой эффективностью, что объясняется большим значением отношения поверхности к объему; Главные внутриклеточные функции у микробов контролируются ферментами; Микроорганизмы выделять во внешнюю среду как клеточные, так и промежуточные продукты обмена; Микробная клетка нуждается в источниках внешней энергии дляподдержания процессов метаболизма, такими источниками являются богатые энергией органические и неорганические соединения или свет;
В зависимости от используемых источников энергии и углерода, конечных продуктов у микроорганизмов выделяют 4 типа метаболизма – бродильный, дыхательный, метаногенный и фототрофный.