Преимущество семенного размножения перед споровым заключается в том, что благодаря семенному размножению образуется, собственно, семя, которое имеет куда больше шансов на успешное прорастание и дальнейшее развитие за счёт многих факторов. В первую очередь - благодаря наличию в его составе множества питательных веществ, которые чаще всего локализованы в семядолях.
Кроме того, семенное размножение чаще всего подразумевает образование семени в результате слияния женских и мужских гамет с различных растений (однако не всегда). Это дает возможность для различных генетических рекомбинаций, которые в значительной мере улучшают (обычно, но не всегда) при молодых растений к окружающей среде.
Ещё одним преимуществом является куда большая устойчивость самого семени как такового к различным негативным аспектам влияния на него окружающей среды. Этот эффект достигается за счёт огромного количества дополнительных оболочек, самыми важными из которых являются непосредственно семенная кожура и мякоть плода или семядолей семени.
Важно также отметить наличие у некоторых растений на семенах наличие многих при которые увеличивают дальность их распространения (парашюты, отростки и т.д.).
