Всегда ли по фенотипу можно определить генотип?

По фенотипу не всегда можно понять, какие гены содержит данная особь. Например, у растения гороха, имеющего жёлтые семена, генотип может быть и АА, и Аа. А вот рецессивный признак проявляется только у гомозиготных растений с генотипом аа. Иными словами, мы всегда знаем, каков генотип у особи с рецессивным признаком.
По фенотипу не всегда можно понять, т.к. фенотипические признаки, определяемые теми или иными генами, в различных условиях существования развиваются по-разному.

Нет. Доминантный ген подавляет действие рецессивного. В результате в фенотипе проявляется признак, который кодируется доминантным геном. В гетерозиготных организмах есть как доминантный так и рецессивный ген, однако в фенотипе проявляется только один (доминантный).