Да имеет.
Само ускорение не может быть ни отрицательным, ни положительным - это вектор. Проекция ускорения на какую-то ось может быть отрицательной. ответившие выше, говоря про торможение, как раз имели в виду проекцию ускорения на направление движения (т. е. на вектор скорости).
