Что имеют в виду когда говорят что в каком то доме нечисто

Они имеют в виду что в этом доме они себя не уютно чувствуют т.е. что то с ним не так...

Либо то, что там поистине грязно :)
Либо то, что там происходили какие-то подозрительные вещи. С домом что-то не хорошее.