Слова в переносном значении есть во всех предложениях.
"Село коптит" - это значит, что в этом селе из многих домов в небо летит дым из печек.
"Город шумел" - это значит, что в нём было много людей, которые что-то делали.
"Я три тарелки съел" - это значит, что человек съел три порции блюда.