Конечно, нужна. Думаю, ты сам знаешь. Думаю здесь является вводным словом и должно отделяться запятой.
Можно изменить построение предложения, превратив его в бессоюзное, тогда надо поставить двоеточие. Думаю: ты сам знаешь.
Но какой - то из знаков обязательно нужен.
Объяснение:
