Человек,убивший дерево,проходит может быть, мимо него каждый день, и каждый день мертвое дерево напоминает ему о содеянном. почему в этом предложении стоят запятые.

1 и 2 это запятые, которые выделяют причастный оборот
 еще у вас пропала запятая перед "может быть" , это вводные слова, тоже выделяются с обеих сторон
 после "день" стоит запятая, так как она разграничивает два предложения (человек проходит - дерево напоминает)