Со знаками препинания в — а вот и ничего, — сказал он. — что значит а вот и ничего? тебя же там не было. нужно ли что-то поставить после "что значит"

— А вот и ничего, — сказал он.

— Что значит ,а вот и ничего? Тебя же там не было.

Да. Правило после а и но пишется запятая

Что значит "а вот и ничего"?

Я бы эту фразу вязал в кавычки, т.к. один человек повторяет слова своего собеседника, т.е. цитирует его слова.

А цитата всегда берётся в кавычки.