Кажется, что золотой, но на самом деле серебряный.
Ставится запятая после слова "кажется", так как оно вводное, а также стоит союз "что". Ставится запятая перед союзом "но".
Допустима постановка тире после "на самом деле" как интонационный авторский знак:
Кажется, что золотой, но на самом деле — серебряный.
