Объяснить зачем тут запятая: в течении долгого времени биологи не могли определить, видит ли в темноте летучая мышь. принесли в кабинет летучую мышь ,(эту не надо) зашторили окна, (эту не надо)заткнули все щели и дыры, следы за тем чтобы в комнату не проникал свет.

В течении долгого времени биологи не могли определить, видит ли в темноте летучая мышь [запятая стоит, потому что это сложное предложение]. Принесли в кабинет летучую мышь, зашторили окна, заткнули все щели и дыры, следя за тем, чтобы в комнату не проникал свет [однородные члены, однородные члены, деепричастный оборот, сложноподчиненное предложение].

Первая запятая, которую Вы не можете объяснить, связывает два простых предложения.